環太平洋防衛軍の活躍によりKAIJUが出現しなくなってから１０年後の世界。 自己犠牲によって異次元への通路を塞いだ英雄のぺントコストの息子であるジェイクは、イェーガー・パイロットとしての高い資質を持ちながらも父の死のトラウマから軍隊を抜け、盗品…